1901年，山東巡撫袁世凱上(shàng)奏《山東試辦大學堂暫行章程折稿》，同時調蓬萊知縣李于锴進行籌備。10月(yuè)(yuè)，《折稿》獲準，在濟南(nán)泺源書院正式創辦了(le)官立山東大學堂。周學熙任管理(lǐ)總辦（校(xiào)長）。第一(yī)批招收學生(shēng)300人(rén)，分(fēn)專齋、正齋、備齋，分(fēn)齋督課。聘請中西(xī)教習50餘人(rén)，後增至110多人(rén)，美國人(rén)赫士爲總教習。課程設置除經史子(zǐ)集外，還有社會科學、自然科學和外國語等20多門。學制初爲三年，後改爲四年。1904年，學校(xiào)遷入濟南(nán)杆石橋新(xīn)址，改爲山東高等學堂。1911年，又改稱山東高等學校(xiào)。方燕年、陳恩焘、蕭應椿、陳慶和、周學淵、魏業銳、陳恩畲、李豫同、李聯璧、範之傑、黃國恩、丁維椽等先後出任校(xiào)長。1912年，國民(mín)政府實行全國設立大學區，各區中心城市(shì)設大學，各省設專門學校(xiào)的體制，按章大學堂應予裁撤，至1914年停辦。師生(shēng)分(fēn)别轉入法政、工業、農業、商(shāng)業、礦業、醫學六個專門學校(xiào)，校(xiào)長丁維椽繼任商(shāng)業專門學校(xiào)校(xiào)長，校(xiào)舍由法政專門學校(xiào)使用。山東大學堂共培養畢業生(shēng)770人(rén)，選送去歐美和日本留學59人(rén)。其中徐鏡心、張伯言等人(rén)在日本參加同盟會，被孫中山先生(shēng)委任爲山東同盟會負責人(rén)。山東大學堂是山東省第一(yī)所官辦的高等學校(xiào)，也(yě)是山東大學曆史的起點。

1906年，在濟南(nán)皇華館設立法政學堂；1907年，再設法律學堂，時稱第一(yī)、第二法政學堂；1913年，合并爲山東公立法政專門學校(xiào)。1907年，山東巡撫楊士骧、吳廷斌又在濟南(nán)東關全福莊設立山東高等農業學堂，以南(nán)郊千佛山、馬鞍山北麓五千畝土(tǔ)地作(zuò)爲學堂的林場；1913年，易名山東公立農業專門學校(xiào)。1912年，留日學生(shēng)葉春墀請準在濟南(nán)南(nán)關設立商(shāng)業學校(xiào)，随後定名山東公立商(shāng)業專門學校(xiào)。1912年，青州府高密中等工業學堂和濟南(nán)工業學堂合并，後又并入山東第一(yī)中學，于第二年在一(yī)中尚志堂校(xiào)舍成立山東公立工業專門學校(xiào)。1915年，山東省設醫學講習所；1916年，改名爲山東省立醫學學校(xiào)，校(xiào)址在濟南(nán)北園白鶴莊； 1920年，正式命名山東公立醫學專門學校(xiào)。1920年，又将礦業傳習所擴建爲山東公立礦業專門學校(xiào)，校(xiào)址設在濟南(nán)東關。上(shàng)述六個專門學校(xiào)課程均爲現代社會科學和自然科學，教師多爲歐美和日本留學生(shēng)。學制一(yī)般爲三年，醫學四年，十餘年共畢業學生(shēng)4000餘人(rén)。在山東大學的發展曆史上(shàng)，這六所專門學校(xiào)起着承前啓後的作(zuò)用。

1926年，奉系軍閥張宗昌督魯，下(xià)令将山東公立六個專門學校(xiào)合并，在濟南(nán)建省立山東大學，由山東省教育廳廳長，清末狀元王壽彭任校(xiào)長。設文、法、工、農、醫五個學院，計有中國哲學、國文學、法律、政治經濟、商(shāng)學、機械、機織、應用化(huà)學、采礦、農學、林學、蠶學、醫學13個系，并設有附屬中學。校(xiào)設評議會，院設教務會，系設教授會，定期研究教學、人(rén)事(shì)、經費等問題。大學部有教師320人(rén)，除專業課外，并開設選修課，學生(shēng)畢業授學士學位。1928年，日本帝國主義借口保護僑民(mín)出兵濟南(nán)，制造了(le)“五三”慘案。在動亂中，學校(xiào)經費無着，随即停辦。

1924年8月(yuè)(yuè)，私立青島大學正式創立，高恩洪任校(xiào)長。設工科和商(shāng)科，學制四年，學生(shēng)修業期滿考試及格者授予學士學位。學生(shēng)除本國外還有南(nán)洋華僑和朝鮮學生(shēng)。革命活動家羅榮桓、彭明晶等系該校(xiào)學生(shēng)。校(xiào)董事(shì)會聘請學界名流梁啓超、蔡元培、張伯苓、黃炎培等人(rén)爲名譽董事(shì)。選用德國人(rén)在青島建造的俾斯麥兵營作(zuò)校(xiào)址。1925年，直奉戰争再起，直系軍閥失敗。高恩洪下(xià)野，學校(xiào)瀕于倒閉。校(xiào)董會公推山東省議長宋傳典接任校(xiào)長，勉強維持。1928年，北伐軍進抵山東後，奉系敗逃，學校(xiào)經費逐漸斷絕停辦，學生(shēng)按大學結業處理(lǐ)。

1928年8月(yuè)(yuè)，國民(mín)政府教育部決定在省立山東大學的基礎上(shàng)籌建國立山東大學。由何思源、魏宗晉、陳雪南(nán)、趙畸、王近信、彭百川、楊亮功、楊振聲、杜光埙、傅斯年、孫學悟等11人(rén)組成國立山東大學籌備委員會，着手籌備工作(zuò)。在籌備過程中，蔡元培先生(shēng)力主将國立山東大學設在青島，取得教育部長蔣夢麟的同意。1929年6月(yuè)(yuè)， 國立山東大學籌備委員會奉令改爲國立青島大學籌備委員會。除接收省立山東大學外，并将私立青島大學校(xiào)産收用，籌備國立青島大學。

1930年4月(yuè)(yuè)，國民(mín)政府任命楊振聲爲校(xiào)長。9月(yuè)(yuè)20日，舉行開學典禮，國立青島大學正式成立。學校(xiào)初設文、理(lǐ)、教育三個學院，分(fēn)爲中國文學系、外國文學系、數學系、物理(lǐ)系、化(huà)學系、生(shēng)物學系、教育行政系和鄉村(cūn)教育系等八個系。1932年9月(yuè)(yuè)，教育學院停辦，學生(shēng)大部分(fēn)轉入國立中央大學教育學院。同時增設工、農兩學院。工學院設土(tǔ)木工程學系和機械工程學系。農學院設于濟南(nán)，設研究、推廣兩部。不久，又将文、理(lǐ)兩學院合并爲文理(lǐ)學院。學校(xiào)設校(xiào)務會議，由校(xiào)長、教務長、秘書長、各學院院長、各學系主任和教授代表組成，負責議決一(yī)切重大事(shì)項。校(xiào)長楊振聲思想進步，富有遠見，效法北京大學“兼容并包”、“科學民(mín)主”的辦學方針，廣聘專家學者，如(rú)聞一(yī)多、黃敬思、黃際遇、任之恭、傅鷹、沈從文、梁實秋、聞宥、遊國恩、曾省、湯騰漢等著名學者均在校(xiào)任教。學校(xiào)發展較快(kuài)，聲譽日隆，國立青島大學由此嶄露頭角。

1932年，國立青島大學改名爲國立山東大學，任命趙太侔（趙畸）接任校(xiào)長。趙太侔原爲國立青島大學教務長，贊同楊振聲的辦學方針。接任後增聘老舍、洪深、張煦、丁山、王淦昌、童第周、曾呈奎等一(yī)批專家學者，師資陣容更爲整齊。同時撙節行政費用，添購圖書、儀器(qì)，先後建成科學館、工學館、體育館、化(huà)學館、水力實驗室及實習工廠等，改善了(le)辦學條件。這時期由于外部環境相對穩定，校(xiào)内人(rén)才荟萃，名流雲集，師生(shēng)勤奮教學、成就(jiù)蜚然，成爲學界仰重的國内知名高等學府。國立山東大學實行“學年學分(fēn)制”，學制四年，學生(shēng)畢業授學士學位。學校(xiào)先後創辦有學術刊物《科學叢刊》、《文史叢刊》、《勵學》、《刁鬥》等。

1937年，“七七”事(shì)變，抗日戰争爆發。11月(yuè)(yuè)，國立山東大學由青島遷往安徽安慶，不久再遷四川萬縣。圖書、儀器(qì)、案卷分(fēn)批運出，損失嚴重。1938年春，學校(xiào)在萬縣複課，不久教育部下(xià)令“暫行停辦”。師生(shēng)轉入國立中央大學，圖書、儀器(qì)、機械分(fēn)别暫交國立中央圖書館、國立中央大學、國立中央工業職業學校(xiào)保管使用。

1948年夏，中共中央華東局決定，以原臨沂山東大學渤海地區的部分(fēn)留守人(rén)員爲基礎，并集中原來的一(yī)些(xiē)教師，會同華中建設大學的部分(fēn)幹部教師，在濰縣組建成立華東大學。同年9月(yuè)(yuè)4日開學。韋悫任校(xiào)長，張勃川、李宇超任副校(xiào)長。濟南(nán)解放(fàng)後，學校(xiào)于11月(yuè)(yuè)遷入濟南(nán)。遷濟後成立文學、社會科學、教育三個學院和一(yī)個研究部。另設附屬中學。1949年5月(yuè)(yuè)，韋悫調任上(shàng)海市(shì)副市(shì)長，彭康接任校(xiào)長，學校(xiào)向正規化(huà)大學過渡。11月(yuè)(yuè)，教育學院劃出，後成爲山東師範大學。附屬中學交濟南(nán)市(shì)領導，改爲實驗中學。1950年，全國教育工作(zuò)會議後，學校(xiào)調整爲政治、文學、史地、藝術、俄文五系，轉入正規化(huà)的業務學習。1950年冬，奉命遷青島；1951年，在青島與山東大學合校(xiào)。華中建設大學、臨沂山東大學和華東大學，都是短期訓練班式的政治大學，爲國家培養了(le)近一(yī)萬名幹部，爲革命戰争和建設作(zuò)出了(le)積極的貢獻。

1958年7月(yuè)(yuè)，山東大學歸由山東省領導，同年10月(yuè)(yuè)，奉命遷校(xiào)濟南(nán)。文科的中文、曆史兩系和理(lǐ)科數學、物理(lǐ)、化(huà)學、生(shēng)物四系搬遷濟南(nán)，海洋、水産和正籌建的地礦三系留在青島（後獨立爲山東海洋學院，即現在的中國海洋大學）。這期間根據科學發展和國家建設事(shì)業的需要，于1959年秋恢複了(le)外文系，1960年，重設政治系，建成原子(zǐ)能(néng)系和電子(zǐ)系，學校(xiào)由遷濟時的6個系10個專業，增至政治、中文、曆史、外文、數學、物理(lǐ)、化(huà)學、生(shēng)物學、原子(zǐ)能(néng)（後學生(shēng)并入複旦大學，該系撤銷）、電子(zǐ)10個系。建立了(le)中國古典文學、中國現代文學、美國文學、中國古代史、微分(fēn)方程（控制論）、磁學、晶體、微生(shēng)物九個校(xiào)屬研究室。有八個專業接受培養研究生(shēng)。設有三個專業的業餘大學，六個專業的函授班，并招收函授研究生(shēng)，在校(xiào)業餘和函授生(shēng)達到4000人(rén)。同時，恢複了(le)外國留學生(shēng)培養工作(zuò)。學校(xiào)遷濟後，全校(xiào)九個系分(fēn)駐兩地，校(xiào)部機關和外文、物理(lǐ)、電子(zǐ)、生(shēng)物四系仍住原處，稱老校(xiào)；政治、中文、曆史、數學、化(huà)學五系遷新(xīn)校(xiào)舍，稱新(xīn)校(xiào)。1961年，學校(xiào)複歸教育部領導，學校(xiào)文科向社會科學領域開拓，理(lǐ)科突出數學、磁學、晶體、微生(shēng)物的六十年代新(xīn)特色，爲學校(xiào)以後的發展打下(xià)了(le)良好(hǎo)(hǎo)的基礎。1970年夏，山東省革命委員會将山東大學一(yī)分(fēn)爲三：政治、中文、外文、曆史四系南(nán)遷曲阜，與曲阜師範學院合并，時稱爲山東大學；生(shēng)物學系遷至泰安，并入山東農學院；校(xiào)部機關和數學、物理(lǐ)、電子(zǐ)、化(huà)學、光學（新(xīn)建）五系留在濟南(nán)，成立山東科學技術大學。1973年，周恩來總理(lǐ)親自批示恢複山東大學原建制。1974年初，山東大學恢複原建制。

1978年，孫漢卿任校(xiào)黨委書記，吳富恒任校(xiào)長。1984年，鄧從豪任校(xiào)長。經教育部批準，1984年在風景秀麗的海濱城市(shì)威海，設立山東大學威海分(fēn)校(xiào)。1986年，徐豫龍任校(xiào)黨委書記。1987年，潘承洞任校(xiào)長。1988年，陳之安任校(xiào)黨委書記。1996年，曾繁仁任校(xiào)黨委書記。1998年，張樂嶺任校(xiào)黨委書記，曾繁仁任校(xiào)長。

2000年7月(yuè)(yuè)，由原山東大學、原山東醫科大學（注1）、原山東工業大學（注2）合并組建新(xīn)的山東大學。朱正昌任校(xiào)黨委書記，展濤任校(xiào)長。2002年8月(yuè)(yuè)，邵桂芳任校(xiào)黨委書記。2005年2月(yuè)(yuè)，朱正昌任校(xiào)黨委書記。2008年11月(yuè)(yuè)，徐顯明任校(xiào)長。2011年10月(yuè)(yuè)，李守信任校(xiào)黨委書記。2013年10月(yuè)(yuè)，張榮任校(xiào)長。